Академик АН СССР. Герой Социалистического Труда, лауреат трех Сталинских премий. Награжден тремя орденами Ленина, орденом Трудового Красного Знамени.
А.И. Алиханов окончил физико-математический факультет Ленинградского политехнического института (ЛПИ) в 1929 году.
В 1927-1941 гг. работал в Ленинградском физико-техническом институте АН СССР, одновременно по совместительству – в ЛПИ (1929-1934 гг.) и в Ленинградском институте инженеров железнодорожного транспорта (1939-1941 гг.).
В 1932-1933 гг. А.И. Алиханов занимался изучением отражения рентгеновских лучей от тонких слоев металлов. Он впервые показал, что процессы отражения и преломления рентгеновских лучей полностью подчиняются законам, выведенным из электромагнитной теории света Д.К. Максвелла.
В 1934 году А.И. Алиханов, Б.С. Джелепов и А.И. Алиханьян одними из первых наблюдали явление искусственной радиоактивности. В 1934 году совместно с А.И. Алиханьяном и М.С. Козодаевым он открыл эффект образования электрон-позитронной пары в результате внутренней конверсии энергии возбужденного ядра, а в 1936 году вместе с А.И. Алиханьяном и Л.А. Арцимовичем экспериментально доказал сохранение энергии и импульса при аннигиляции электрона и позитрона.
В 1941 году за научные исследования по радиоактивности А.И. Алиханову совместно с А.И. Алиханьяном присуждена Сталинская премия.
В 1942 году А.И. Алиханов работал в Институте физических проблем АН СССР. Совместно с А.И. Алиханьяном он выполнил прецизионные исследования бета-спектров большого количества радиоактивных элементов, предложил идею опытов для доказательства реальности существования нейтрино, осуществил ряд экспериментов по физике космических лучей на горе Арагац, которые стимулировали развитие нового направления – физики элементарных частиц.
В 1943-1945 гг. – сотрудник Лаборатории № 2 АН СССР (ныне НИЦ "Курчатовский институт"), в 1944 году – начальник сектора № 1, в 1945 году – заведующий сектором Ленинградского филиала Лаборатории № 2 АН СССР.
В 1945-1968 гг. – начальник Лаборатории № 3 АН СССР (впоследствии - Теплотехническая лаборатория, ныне Институт теоретической и экспериментальной физики НИЦ "Курчатовский институт").
В 1945-1953 гг. А.И. Алиханов занимал должность ученого секретаря Технического совета Спецкомитета СМ СССР, а затем члена научно-технического совета Первого главного управления Совета министров СССР.
В 1948 году за работы по исследованию космических лучей и природы элементарных частиц А.И. Алиханову совместно с А.И. Алиханьяном присуждена Сталинская премия.
В 1949 году в ИТЭФ под руководством А.И. Алиханова был сооружен первый в СССР тяжеловодный исследовательский ядерный реактор. На этом реакторе А.И. Алиханов и его сотрудники провели важные для проектирования и сооружения других реакторов измерения ядерно-физических констант.
Под руководством А.И. Алиханова и В.В. Владимирского были разработаны и сооружены промышленные тяжеловодные реакторы для производства плутония, трития, опытные тяжеловодные реакторы в Югославии и Китае, тяжеловодный реактор с газовым охлаждением КС-150 для атомной электростанции А-1, вступившей в строй в Богунице (Словакия) в 1972 году.
Внес значительный вклад в развитие экспериментальной базы физики высоких энергий. Начиная с 1952 года А.И. Алиханов вместе с В.В. Владимирским разрабатывали ускорители высоких энергий, работающие на принципе жесткой фокусировки. В 1961 году под руководством А.И. Алиханова создан и пущен ускоритель протонов на 7 ГэВ в ИТЭФ, в 1968 году разработан проект ускорителя протонов на 70 ГэВ в Протвино, в то время – самого большого в мире.
В музее НИЦ "Курчатовский институт" открылась выставка, посвященная А.И. Алиханову. В экспозиции представлены его научные труды, а также фотографии и документы, рассказывающие о жизни ученого.