По итогам 2011 года НИИИС награжден штандартом губернатора «За активное участие в федеральных целевых программах».
Торжественная церемония награждения состоялась 28 февраля 2012 года в Нижегородском Кремле. Награду директору НИИИС Андрею Юлиевичу Седакову вручил губернатор области Валерий Павлинович Шанцев.
НИИИС неоднократно удостаивался высоких региональных наград и из года в год удерживает свои лидирующие позиции среди предприятий города и области. Институт ежегодно увеличивает объемы инвестиций в техническое перевооружение научно-производственной базы, что позволяет обеспечить 100% выполнение Гособоронзаказа, постоянно наращиваются общие объемы работ, включая растущие заказы по атомной энергетике.