31 августа 2021 г. опубликован глобальный рейтинг лучших университетов мира – Московский Международный Рейтинг Вузов «Три Миссии Университета» 2021. НИЯУ МИФИ занял 5 место среди всех российских вузов и 145 место в мире (147 место в 2020 году). По качеству образования НИЯУ МИФИ вошёл в топ-100 лучших университетов мира.
Важно отметить, что количество ранжируемых университетов и соответственно конкуренция возросла – 1500 в 2020 году и 1650 в 2021 г. По этому параметру рейтинг является самым представительным в мире. В список лучших вошли вузы из 97 стран мира. Россия сохранила позиции в тройке мировых лидеров по представленности в рейтинге (112 университетов), уступив лишь США и Китаю (239 и 144 университета соответственно). В топ-200 рейтинга вошли 5 российских вузов, из них в топ-100 вошли 3 вуза.
Для составления рейтинга, как отмечают составители рейтинга, использовались только объективные критерии, одобренные международными экспертами; репутационные опросы полностью исключены. Источниками информации стали открытые данные официальных сайтов университетов и национальных органов власти, а также данные независимых международных источников: провайдер библиометрических данных Clarivate Analytics; крупнейший агрегатор платформ онлайн-курсов Class Central; платформы массового образования «Открытое образование» (Россия) и icourse163.org (Китай); общедоступная многоязычная универсальная энциклопедия «Википедия»; поисковые системы Google, «Яндекс», Baidu; социальные сети Facebook, Twitter, VK, Sina Weibo; компания Alexa, один из мировых лидеров в области веб-аналитики; веб-сайты международных олимпиад студентов; веб-сайты научных премий из списка IREG List of International Academic Awards.