Айсен Сергеевич Николаев родился 22 января 1972 года в г. Ленинграде.
В 1994 году окончил физический факультет Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова.
Трудовую деятельность начал в финансовой корпорации «САПИ».
В 1995 году назначен заместителем председателя правления «Алмазэргиэнбанка». В 1998 году Айсен Николаев возглавил «Алмазэргиэнбанк».
В 2004 году назначен министром финансов Республики Саха (Якутия).
С 2007 года работал руководителем Администрации Президента и Правительства Республики Саха (Якутия).
В 2011 году назначен первым заместителем Председателя Правительства Республики Саха (Якутия).
4 марта 2012 года избран главой города Якутска. 10 сентября 2017 года избран главой города Якутска на второй срок.
28 мая 2018 года Указом Президента России В.В. Путина назначен временно исполняющим обязанности Главы Республики Саха (Якутия).
На выборах 9 сентября 2018 года Айсен Сергеевич Николаев избран Главой Республики Саха (Якутия).
Избирался депутатом Государственного Собрания (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия) II, III созывов. Заслуженный работник народного хозяйства Республики Саха (Якутия). Награжден Грамотами Совета Федерации, Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации.