Предприятие «Хартрон» было основано в г. Харькове в 1959 году как научно-производственное объединение (НПО «Электроприбор», КБЭ, п/я 67) по разработке, производству и эксплуатации автоматических систем управления ракетно-космическими комплексами. Особое конструкторское бюро (ОКБ-692, а/я 67) по системам управления межконтинентальных ракет, размещалось тогда на Змиевском шоссе (теперь – проспект Гагарина).
В бывшем СССР (единственное на Украине) предприятие входило в тройку ведущих фирм, создававших системы управления для ракетно-космической техники (в том числе для межконтинентальных баллистических ракет SS-18 и SS-19).
Ракеты-носители с системами управления разработки «Хартрона» («Циклон», «Энергия» и др.) вывели на орбиту около 1000 космических аппаратов серии «Космос», «Целина», «Океан», «Коронас», «Купон» и др.
Опыт создания систем управления для модулей «Квант-1», «Квант-2», «Кристалл», «Спектр», «Природа» космического комплекса «Мир» позволил «Хартрону» разработать и успешно применить системы автоматической стыковки для функционально-грузового блока «Заря» международной космической станции (МКС).
Новые экономические условия поставили перед «Хартроном» новые задачи. Ныне акционерное общество «Хартрон» представляет собой «холдинговую» компанию, предприятия которой, расположенные в Харькове и Запорожье, специализируются на решении широкого круга народно-хозяйственных задач с использованием накопленного уникального научно-технологического потенциала «Хартрона». Впоследствии из ряда основных подразделений КБЭ был образован «Хартрон-Аркос», к которому в итоге перешла вся основная тематика предприятия. В разные годы руководителями предприятия были Борис Михайлович Коноплев, Владимир Григорьевич Сергеев, Анатолий Григорьевич Андрющенко, Яков Ейнович Айзенберг.
В настоящее время «Хартрон-Аркос» активно участвует в украинских, российских и международных космических проектах, создавая новые и модифицируя доказавшие свою высокую надежность уже существующие системы управления ракет-носителей для обеспечения коммерческих пусков (комплексы «Циклон-4», «Днепр», «Рокот», «Стрела»).