Евгений Абакумов с отличием окончил МГТУ им. Баумана, где учился с 1997 по 2003 год. Специальность - «Стандартизация и сертификация в машиностроении».
В 2013 году прошел курс MBA НИУ ВШЭ по специальности «Стратегический менеджмент».
С 2003 года Евгений Абакумов работал во ВНИИА им. Духова, где занимался разработкой стандартов предприятия, развития и совершенствования системы менеджмента качества, был руководителем группы качества.
С 2009 года возглавлял ИТ-отделение во ВНИИА им. Духова.
В 2007-2010 гг. Евгений Абакумов принимал участие в разработке новой системы управления проектами НИР и ОКР на клиент-серверной платформе Oracle-Delphi, в 2011-2014 гг. - в разработке информационно-поисковой системы АСУ «Оснастка» для блоков автоматики, а также для хранения и поиска информации о калибрах и управляющих программах для электроэрозионных станков с ЧПУ. Сыграл роль в переходе ВНИИА им. Духова на использование электронной конструкторской документации, руководил внедрением ряда проектных решений в области использованиясуперкомпьютеров на предприятии.
Под руководством и с участием Абакумова осуществлены проекты по внедрению систем в областях управления данными об изделиях, управления дискретным производством, нормативно-справочной информации и др. За время его работы во ВНИИА была создана система управления дискретным производством «Призма», успешно внедренная на ряде предприятий госкорпорации «Росатом».
Также принимал участие в программе трансформации ИТ «Росатома», которая осуществлялась с 2009 по 2017 гг.
С 2018 года - руководитель Департамента информационных технологий Росатома