Окончил в 1994 году Московский государственный технический университет им. Н.Э. Баумана по специальности «Радиоэлектронные устройства и системы». В 2001 году – Финансовую академию при Правительстве Российской Федерации по специальности «Бухгалтерский учет и аудит».
В 2008-2013 гг. работал в ОАО «ТВЭЛ», прошел карьерный путь от заместителя главного бухгалтера до вице-президента по экономике и финансам. В 2013 году занимал должность первого заместителя генерального директора ФГУП «Федеральный центр ядерной и радиационной безопасности» (ФГУП «ФЦЯРБ»). В 2014 - 2015 гг. – финансовый директор ОАО «Атомредметзолото».
С 15 июля 2015 года Сергей Александрович Мигалин, ранее занимавший должность финансового директора Уранового холдинга АРМЗ, назначен на должность заместителя Генерального директора – директора по экономике и финансам АО «Концерн Росэнергоатом».
Основные функциональные задачи, входящие в зону ответственности Сергея Александровича Мигалина в должности заместителя Генерального директора – директора по экономике и финансам АО «Концерн Росэнергоатом»: