Национальный исследовательский центр создается на базе Курчатовского института, Петербургского института ядерной физики имени Константинова РАН, а также двух институтов Росатома — Института физики высоких энергий и Института теоретической и экспериментальной физики.
Для участия Курчатовского института в программе правительство выделило Минобрнауки 1,18 миллиарда рублей. РАН для Петербургского института ядерной физики выделено 1,25 миллиарда рублей.
Росатому выделено 574,2 миллиона рублей для обеспечения участия в программе Института физики высоких энергий и Института теоретической и экспериментальной физики.
Президент РФ Дмитрий Медведев ранее подписал федеральный закон «О национальном исследовательском центре „Курчатовский институт“, создающий условия для работы центра как одного из ключевых элементов инновационной национальной системы.
Согласно закону, утверждать программу совместной деятельности организаций, входящих в состав центра, будет правительство России, а финансироваться она будет за счет средств федерального бюджета.
На реализацию в 2010–2012 годах программы „Курчатовского института“, которая затрагивает его совместную деятельность с рядом других ведущих исследовательских центров — Институтом ядерной физики имени Константинова, Институтом физики высоких энергий, Институтом теоретической и экспериментальной физики — планируется дополнительно выделить 10 миллиардов рублей.