Генеральная конференция в составе представителей государств — членов МАГАТЭ проводит регулярные ежегодные сессии, обычно в сентябре, на которых она рассматривает и утверждает бюджет МАГАТЭ и принимает решения по другим вопросам, выносимым на ее рассмотрение Советом управляющих, Генеральным директором или государствами-членами.
Представители государств — членов МАГАТЭ и приглашенные государства, не являющиеся членами, и организации могут зарегистрироваться для участия в Генеральной конференции в соответствии с такими правилами, которые утвердила Генеральная конференция.
В начале каждой ежегодной сессии Генеральная конференция избирает председателя и членов Генерального комитета. Они занимают должность в течение конкретной сессии.
Совместно с Генеральной конференцией МАГАТЭ регулярно организует Научный форум по темам, связанным с ядерными технологиями и наукой.