ФГУП «Гидрографическое предприятие» предназначено для решения следующих задач:
1. Навигационно-гидрографическое обеспечение мореплавания в акватории Северного морского пути (далее - СМП), в акваториях морских портов, расположенных на побережье акватории СМП, и на подходах к ним, а также в устьевых участках рек Енисей, Хатанга и Колыма с морским режимом судоходства в целях создания благоприятной навигационной обстановки для обеспечения безопасности плавания судов в акватории СМП.
2. Поддержание в надлежащем состоянии, обеспечение функционирования, модернизация и новое строительство систем (средств) обеспечения навигационной безопасности мореплавания, в том числе расположенных в морских портах и на подходах к ним.
3. Ремонт, модернизация и новое строительство гидротехнических сооружений и других портовых объектов, в том числе перегрузочных комплексов и терминалов в акватории СМП.
4. Выполнение функции национального координатора НАВАРЕА в географических районах НАВАРЕА ХХ и ХХI для обеспечения:
5. Выполнение функций и полномочий государственного заказчика в части строительства объектов федеральной собственности в акватории СМП, в том числе на побережье, в устьевых участках рек с морским режимом судоходства, в морских портах, расположенных на побережье акватории СМП, и на подходах к ним.
6. Выполнение функций Заказчика застройщика при строительстве и модернизации гидрографических судов, других плавсредств.
7. Взимание портовых сборов в морских портах Российской Федерации, расположенных на побережье акватории СМП.
8. Лоцманская проводка судов на устьевых участках рек Енисей, Хатанга и Колыма, в акваториях морских портов расположенных на побережье акватории СМП и на подходах к ним.
По материалам гидрографических исследований и работ, выполненных Предприятием, созданы и поддерживаются на современном уровне 638 морских навигационных карт Российской Федерации на акваторию Северного морского пути, а также пять лоций и десять руководств и пособий для плавания.
В хозяйственном ведении Предприятия находится 1238 средств навигационного оборудования (далее — СНО), из них: 1043 береговых объекта и 195 плавучих предостерегательных знака.
Передача информации по безопасности на море осуществляется Центром информации по безопасности на море (г. Санкт-Петербург) и Береговой станцией НАВТЕКС (п. Тикси).